深圳先进光源研究院是深圳市委市政府贯彻落实双区驱动和创新驱动发展国家重大战略、支撑大湾区综合性国家科学中心建设的公益性科研事业单位
深圳市大数据研究院(Shenzhen Research Institute of Big Data)
深圳市人工智能与机器人研究院（AIRS）成立于 2019 年，是深圳市政府依托香港中文大学（深圳）建立的市级十大基础研究机构之一。
中国科学院深圳先进技术研究院（简称深圳先进院）成立于2006年
深圳合成生物学创新研究院 (以下简称合成院)是依托中国科学院深圳先进技术研究院建设的新型基础研究机构。
深圳医学科学院（Shenzhen Medical Academy of Research and Translation
河套数学与交叉科学研究院(深圳)是深圳市新成立的事业单位,致力于推动基础学科与应用学科的融合发展。
人工智能与数字经济广东省实验室(深圳)(以下简称光明实验室)为广东省政府批准筹建的第三批广东省实验室之一
滨州魏桥国科高等技术研究院(简称研究院)是由世界500强企业山东魏桥创业集团支持创办、中国科学院大学战略协同的新型研发机构。
深圳计算科学研究院(简称深算院)是深圳市重点打造的十大基础研究机构之一
深圳先进电子材料国际创新研究院(以下简称电子材料院于2019年正式成立,聚焦集成电路高端电子封装材料。
深圳平湖实验室是国家第三代半导体技术创新中心(深圳)依托单位,2022年8月,由深圳市科技创新局举办成立。
电子科技大学(深圳)高等研究院(以下简称高研院)由电子科技大学与深圳市人民政府于2019年12月携手共建,2020年3月正式落户深圳市龙华区。
粤港澳大湾区（广东）量子科学中心为广东省科学技术厅、深圳市科技创新委员会、南方科技大学共同举办的省级事业单位。
成立于2010年11月,是由深圳市政府与北京航空航天大学合作共建直属于北京航空航天大学的二级事业单位。
鹏城国家实验室是中央批准成立的突破型、引领型、平台型一体化的网络通信领域新型科研机构。
深圳市科达嘉电子有限公司是一家专业研发与生产功率电感、共模电感等磁性元件的国家高新技术企业、深圳市专精特新企业。
深圳湾实验室面向世界科技前沿和人民生命健康
南航深圳研究院是由南京航空航天大学独立举办的深圳市属事业单位。